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enLbCas12a Nuclease

货号 32135 售价(元) 询价
规格 100pmoL/1000pmoL CAS号
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产品简介

enLbCas12a(enhanced LbCas12a)是一种基于野生型LbCas12a核酸内切酶升级改造获得的高活力LbCas12a突变体。与野生型LbCas12a的作用机制一样,enLbCas12a也通过crRNA介导,靶向识别带有PAM序列(5’-TTN-3’)的双链DNA,使DNA双链断裂并产生粘性末端。同时,enLbCas12a对单链DNA靶标的识别和剪切不依赖PAM序列。双链或单链DNA靶标均能激活enLbCas12a的反式剪切活性(即旁路剪切活性/附属剪切活性),即当enLbCas12a酶与crRNA、靶标DNA结合形成三元复合物后,便会被激活针对非特异ssDNA序列的反式剪切活性,将体系中的ssDNA序列切碎。因此,enLbCas12a酶不仅可用于体外dsDNA的特异剪切,也可用于靶标核酸的快速检测。

 

产品组分

组分 32135-01 (100 pmol) 32135-03 (1,000 pmol)
enLbCas12a Nuclease (10 μM) a 100 pmol 1,000 pmol
10×HOLMES Buffer for Cas12a 1 mL 1 mL

a. enLbCas12a Nuclease浓度为10 μM,即10 pmol/μL;100 pmol规格的总体积为10 μL,1,000 pmol规格的总体积为100 μL;

 

保存条件

-80℃或-20℃储存;干冰运输。

 

活性定义

在总体积为20 μL的1 × HOLMES Buffer for Cas12a [pH 8.5]反应体系中,37℃反应条件下,1 min内剪切1 pmol ssDNA探针所需的Cas12a酶量定义为1 transU。

例:若某批次enLbCas12a酶的反式切割活性为80.0 transU/pmol,则表明1 pmol的该批次enLbCas12a酶可在1 min内,在上述指定的反应条件下,反式切割80 pmol ssDNA探针。

 

实验流程

1. 顺式剪切实验

组分 体积 终浓度
10×HOLMES Buffer for Cas12a 2 μL 1 ×
10 μM enLbCas12a Nuclease 0.5 μL 250 nM
10 μM crRNA 0.5 μL 250 nM
1 μM Target DNA b 0.5 μL 25 nM
Nuclease-free Water Up to 20 μL  

b. 顺式剪切体系中Target DNA可为ssDNA或带PAM序列的dsDNA。

若用核酸电泳来分析顺式剪切产物,建议使用dsDNA靶标,因为ssDNA靶标会被反式激活的Cas12a进一步切碎。对于20 μL顺式剪切应体系,推荐target DNA的使用量为100 ng~500 ng,且target DNA片段长度在300 bp~3 kb范围内。不同长度target DNA需要的Cas酶和crRNA的量需要根据target DNA的摩尔量计算,建议保持Cas酶:crRNA:target DNA的摩尔比为10:10:1,以尽量确保target DNA被剪切完全。

37℃反应30 min ~ 1 h,85℃灭活5 min,核酸电泳分析顺式剪切产物。

 

2. 反式剪切实验

组分 体积 终浓度
10×HOLMES Buffer for Cas12a 2 μL 1 ×
10 μM enLbCas12a Nuclease  0.05~0.5 μL 25~250 nM
10 μM crRNA 0.05~0.5 μL 25~250 nM
1 μM Target DNA c 0.5~5 μL 25~250 nM
10 μM ssDNA Reporter 0.05~0.5 μL 25~250 nM
Nuclease-free Water Up to 20 μL  

c. 反式剪切体系中Target DNA可为ssDNA或带PAM序列的dsDNA。

反式剪切体系中各组分的用量可以根据不同的实验目的进行调整,用量较少时可先将各组分稀释后加入体系,enLbCas12a Nuclease可用1×HOLMES Buffer for Cas12a稀释,稀释后需立即使用(若要稀释后的Cas12酶长期保存,请使用Cas12 Dilution Buffer,#32012),crRNA、Target DNA及ssDNA Reporter可用Nuclease-free Water稀释,但极低浓度的Target DNA(例如LOD实验)建议用0.1% Tween 20稀释并使用低吸附的离心管、吸头等耗材。

实时荧光定量PCR仪检测荧光信号,37℃反应,每30 sec采集一次荧光信号。

 

实验结果

顺式剪切

反式剪切

 

注意事项


1. 高活力的enLbCas12a酶crRNA的DR序列(Direct Repeat)与野生型LbCas12a(#32108)一致,可以在反应体系中用enLbCas12a酶直接替换野生型LbCas12a。
2. 不同来源的Cas12a酶,其识别靶标所需的PAM位点也略有不同,其中大部分Cas12a酶可识别TTN或TTTN位点。
3. Cas12a的顺式剪切(cis-cleavage):Cas12a在crRNA的引导下,特异性地剪切target DNA。dsDNA靶标需带有PAM位点,而ssDNA靶标不依赖PAM位点。
4. Cas12a的反式剪切(trans-cleavage):当target DNA存在时,Cas12a/crRNA与target DNA形成三元复合物(Cas12a/crRNA/target DNA),同时,Cas12a被激发反式剪切活性,将反应体系中任意序列的单链DNA切碎。
5. 利用本产品的反式剪切活性进行分子诊断实验,可参考本公司的HOLMES体系[1]。
6. 为防止RNase污染,请保持实验区干净整洁,操作时需穿戴干净的手套、口罩,实验所用枪头、离心管等耗材均为RNase-free。
7. Cas12a酶对热敏感,容易失活,应全程冰上配置反应体系,并在使用后立即将酶置于-20℃保存。
8. 本产品仅供科研使用。